Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lysmd3Q99LE3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lysmd3Q99LE3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lysmd3Q99LE3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms