Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lactb2Q99KR3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms