Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk9Q99J95 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk9Q99J95 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk9Q99J95 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms