Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TSG101Q99816 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSG101Q99816 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSG101Q99816 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms