Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PIK3R4Q99570 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
PIK3R4Q99570 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PIK3R4Q99570 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PIK3R4Q99570 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms