Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT12Q99456 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT12Q99456 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT12Q99456 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms