Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YME1L1Q96TA2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
YME1L1Q96TA2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
YME1L1Q96TA2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
YME1L1Q96TA2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.7 ms