Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC44.27■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
RSF1Q96T23 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
RSF1Q96T23 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
RSF1Q96T23 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
RSF1Q96T23 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
RSF1Q96T23 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC44.13■■■■■ 4.65
RSF1Q96T23 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
RSF1Q96T23 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
RSF1Q96T23 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
RSF1Q96T23 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
RSF1Q96T23 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
RSF1Q96T23 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
RSF1Q96T23 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
RSF1Q96T23 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
RSF1Q96T23 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
RSF1Q96T23 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
RSF1Q96T23 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC44.02■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
RSF1Q96T23 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.63
RSF1Q96T23 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms