Protein–RNA interactions for Protein: Q96T21

SECISBP2, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2Q96T21 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SECISBP2Q96T21 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SECISBP2Q96T21 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms