Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRNT1Q96Q11 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNT1Q96Q11 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms