Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPATA13Q96N96 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATA13Q96N96 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA13Q96N96 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPATA13Q96N96 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms