Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00167Q96N53 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms