Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCZQ96LD1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCZQ96LD1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms