Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00208Q96KT6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00208Q96KT6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms