Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC136Q96JN2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC136Q96JN2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC136Q96JN2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CCDC136Q96JN2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms