Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC39.82■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC39.82■■■■□ 3.97
JPH4Q96JJ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC39.79■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
JPH4Q96JJ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
JPH4Q96JJ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC39.66■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC39.65■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
JPH4Q96JJ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
JPH4Q96JJ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
JPH4Q96JJ6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
JPH4Q96JJ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
JPH4Q96JJ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
JPH4Q96JJ6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
JPH4Q96JJ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
JPH4Q96JJ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
JPH4Q96JJ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
JPH4Q96JJ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms