Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
COG3Q96JB2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
COG3Q96JB2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
COG3Q96JB2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
COG3Q96JB2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
COG3Q96JB2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
COG3Q96JB2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
COG3Q96JB2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
COG3Q96JB2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
COG3Q96JB2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
COG3Q96JB2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
COG3Q96JB2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
COG3Q96JB2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
COG3Q96JB2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
COG3Q96JB2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
COG3Q96JB2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms