Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3YL1Q96HL8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3YL1Q96HL8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms