Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRELD1Q96HD1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRELD1Q96HD1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms