Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCMH1Q96GD3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCMH1Q96GD3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms