Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRRFQ96E11 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRRFQ96E11 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRRFQ96E11 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms