Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCN3Q96D15 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCN3Q96D15 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms