Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C12orf43Q96C57 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf43Q96C57 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf43Q96C57 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms