Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UPRTQ96BW1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPRTQ96BW1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPRTQ96BW1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPRTQ96BW1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPRTQ96BW1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPRTQ96BW1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPRTQ96BW1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPRTQ96BW1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UPRTQ96BW1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPRTQ96BW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPRTQ96BW1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPRTQ96BW1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPRTQ96BW1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPRTQ96BW1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms