Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APH1AQ96BI3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APH1AQ96BI3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APH1AQ96BI3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APH1AQ96BI3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APH1AQ96BI3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APH1AQ96BI3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APH1AQ96BI3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APH1AQ96BI3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APH1AQ96BI3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APH1AQ96BI3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms