Protein–RNA interactions for Protein: Q95460

MR1, Major histocompatibility complex class I-related gene protein, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MR1Q95460 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MR1Q95460 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MR1Q95460 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MR1Q95460 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MR1Q95460 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MR1Q95460 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MR1Q95460 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MR1Q95460 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MR1Q95460 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MR1Q95460 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MR1Q95460 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MR1Q95460 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MR1Q95460 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MR1Q95460 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MR1Q95460 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MR1Q95460 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MR1Q95460 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MR1Q95460 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MR1Q95460 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MR1Q95460 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MR1Q95460 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MR1Q95460 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MR1Q95460 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MR1Q95460 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MR1Q95460 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MR1Q95460 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MR1Q95460 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MR1Q95460 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MR1Q95460 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MR1Q95460 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MR1Q95460 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MR1Q95460 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MR1Q95460 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MR1Q95460 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MR1Q95460 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MR1Q95460 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MR1Q95460 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MR1Q95460 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MR1Q95460 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MR1Q95460 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MR1Q95460 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MR1Q95460 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MR1Q95460 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MR1Q95460 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MR1Q95460 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MR1Q95460 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MR1Q95460 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MR1Q95460 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MR1Q95460 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MR1Q95460 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MR1Q95460 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MR1Q95460 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MR1Q95460 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MR1Q95460 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MR1Q95460 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MR1Q95460 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MR1Q95460 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MR1Q95460 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MR1Q95460 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MR1Q95460 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MR1Q95460 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MR1Q95460 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MR1Q95460 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MR1Q95460 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MR1Q95460 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MR1Q95460 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MR1Q95460 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MR1Q95460 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MR1Q95460 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MR1Q95460 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MR1Q95460 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MR1Q95460 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MR1Q95460 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MR1Q95460 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MR1Q95460 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MR1Q95460 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MR1Q95460 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MR1Q95460 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MR1Q95460 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MR1Q95460 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MR1Q95460 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MR1Q95460 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MR1Q95460 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MR1Q95460 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MR1Q95460 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MR1Q95460 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MR1Q95460 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MR1Q95460 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MR1Q95460 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MR1Q95460 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MR1Q95460 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MR1Q95460 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MR1Q95460 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MR1Q95460 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MR1Q95460 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MR1Q95460 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MR1Q95460 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MR1Q95460 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MR1Q95460 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MR1Q95460 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms