Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX1Q92499 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX1Q92499 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX1Q92499 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX1Q92499 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX1Q92499 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX1Q92499 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX1Q92499 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms