Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nrif1Q923B3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrif1Q923B3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrif1Q923B3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrif1Q923B3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms