Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msantd4Q91YU3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Msantd4Q91YU3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msantd4Q91YU3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msantd4Q91YU3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msantd4Q91YU3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msantd4Q91YU3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msantd4Q91YU3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msantd4Q91YU3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msantd4Q91YU3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msantd4Q91YU3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msantd4Q91YU3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msantd4Q91YU3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms