Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y19

Pcdha11, Protocadherin alpha 11, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha11Q91Y19 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pcdha11Q91Y19 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdha11Q91Y19 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms