Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usb1Q91W78 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usb1Q91W78 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usb1Q91W78 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms