Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.7 ms