Protein–RNA interactions for Protein: Q91VN6

Ddx41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx41Q91VN6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx41Q91VN6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx41Q91VN6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx41Q91VN6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx41Q91VN6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx41Q91VN6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx41Q91VN6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx41Q91VN6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx41Q91VN6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx41Q91VN6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx41Q91VN6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx41Q91VN6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx41Q91VN6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx41Q91VN6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
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