Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps3Q91VB4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hps3Q91VB4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hps3Q91VB4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps3Q91VB4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms