Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF31Q8WWY3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF31Q8WWY3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF31Q8WWY3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF31Q8WWY3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms