Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmcd1Q8VEE1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmcd1Q8VEE1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lmcd1Q8VEE1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmcd1Q8VEE1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms