Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD75

Hip1, Huntingtin-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1Q8VD75 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hip1Q8VD75 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hip1Q8VD75 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hip1Q8VD75 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hip1Q8VD75 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms