Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ttc8Q8VD72 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc8Q8VD72 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc8Q8VD72 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc8Q8VD72 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms