Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpap2Q8VC34 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap2Q8VC34 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms