Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC33

Nxnl1, Nucleoredoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxnl1Q8VC33 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxnl1Q8VC33 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxnl1Q8VC33 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxnl1Q8VC33 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxnl1Q8VC33 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxnl1Q8VC33 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxnl1Q8VC33 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxnl1Q8VC33 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nxnl1Q8VC33 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nxnl1Q8VC33 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nxnl1Q8VC33 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nxnl1Q8VC33 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nxnl1Q8VC33 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nxnl1Q8VC33 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nxnl1Q8VC33 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nxnl1Q8VC33 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms