Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BbxQ8VBW5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BbxQ8VBW5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BbxQ8VBW5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BbxQ8VBW5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BbxQ8VBW5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BbxQ8VBW5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BbxQ8VBW5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BbxQ8VBW5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BbxQ8VBW5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BbxQ8VBW5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BbxQ8VBW5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BbxQ8VBW5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BbxQ8VBW5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BbxQ8VBW5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms