Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM1Q8TC05 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MDM1Q8TC05 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms