Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PMFBP1Q8TBY8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PMFBP1Q8TBY8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PMFBP1Q8TBY8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PMFBP1Q8TBY8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PMFBP1Q8TBY8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PMFBP1Q8TBY8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PMFBP1Q8TBY8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PMFBP1Q8TBY8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PMFBP1Q8TBY8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PMFBP1Q8TBY8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PMFBP1Q8TBY8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PMFBP1Q8TBY8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PMFBP1Q8TBY8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PMFBP1Q8TBY8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PMFBP1Q8TBY8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms