Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg10Q8R1P4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg10Q8R1P4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg10Q8R1P4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms