Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF555Q8NEP9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms