Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPER1Q8NEC5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CATSPER1Q8NEC5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CATSPER1Q8NEC5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms