Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C2CD4AQ8NCU7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2CD4AQ8NCU7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C2CD4AQ8NCU7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms