Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPRYD3Q8NCJ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPRYD3Q8NCJ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPRYD3Q8NCJ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPRYD3Q8NCJ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPRYD3Q8NCJ5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPRYD3Q8NCJ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPRYD3Q8NCJ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPRYD3Q8NCJ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms