Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC38A9Q8NBW4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A9Q8NBW4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A9Q8NBW4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A9Q8NBW4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A9Q8NBW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A9Q8NBW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A9Q8NBW4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A9Q8NBW4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A9Q8NBW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A9Q8NBW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A9Q8NBW4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A9Q8NBW4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A9Q8NBW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A9Q8NBW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms