Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C10orf53Q8N6V4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf53Q8N6V4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf53Q8N6V4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf53Q8N6V4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf53Q8N6V4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf53Q8N6V4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C10orf53Q8N6V4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C10orf53Q8N6V4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C10orf53Q8N6V4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C10orf53Q8N6V4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf53Q8N6V4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms